Khác với các phim ký sự truyền hình trước, như: Ký sự hỏa xa, Ký sự Tân Đảo... được thực hiện theo dạng ký sự thực tế ghi hình, dựng và phát sóng ngay trên đường đi, Bên dòng Mississippi trở lại cách làm phim ký sự kiểu truyền thống, nghĩa là đoàn phim đi ghi hình rồi về nước làm hậu kỳ và phát sóng, nhờ vậy phim bảo đảm yếu tố nghệ thuật lẫn chất lượng kỹ thuật.

Đoàn làm phim này đã khởi hành từ tháng 3-2009 và có thể xem là đoàn phim Việt Nam đầu tiên thực hiện một bộ phim dài nhất trên đất Mỹ. Trong thời gian chưa đến 45 ngày, đoàn đã thực hiện lộ trình dài 20.000 km đi qua 10 tiểu bang, 21 thành phố của Mỹ để quay 4.800 phút hình ảnh xây dựng nên bộ phim.[5]